农业科学试验区位于基地的西侧，占地156.68公顷。主要功能包括农作物育种、作物栽培、植物保护、土壤肥料等学科的试验研究，相关农业科研辅助设施有晒场、挂藏室、样品库和农机库等。农业科学试验区采用规整式的传统农业布局形式，划分为3—12公顷大小不等的试验用地；作为主要的育种作物有小麦、玉米、棉花、芝麻、油菜、大豆、花生等。试验田道路景观绿化采用果树作为行道树，形成春花烂漫、夏秋果实累累的农业自然景观。