河南省首款猪三维基因组解析工具研发成功填补省内技术空白

河南经济报记者郭俊娟通讯员郭亚苹

近日，河南省农业科学院畜牧研究所猪育种团队成功研发国内首款猪全基因组启动子互作位点靶向捕获探针商化产品，标志着我省在猪三维基因组解析工具领域实现零的突破，将有效提升生猪育种分子标记选择精度。

这款产品可以通俗理解为给猪的基因装上“精准导航”，突破传统“就近猜测”调控关系的局限性，为锁定真正调控性状的候选功能基因与位点提供重要依据。

河南是全国生猪养殖大省，当前生猪基因选择主要依靠分子标记。常规基因分析方法容易误判非编码区域调控的靶基因，而传统染色质构象捕获技术存在数据需求大、成本高、难以规模化应用等问题。

此次研发的探针，突破线性基因组局限，可高效捕获启动子与调控元件的远程互作，精准构建“候选功能变异—靶基因”关联，大幅提升调控网络解析效率，显著降低实验成本与数据需求。

该探针覆盖猪2.2万个基因启动子区域，在60G测序数据量下可检测出有效染色质互作1.3亿对，顺式互作占比约77%，反式互作占比约33%，探针锚定区域与基因组其他区域互作比例约92%，具备覆盖全面、成本低廉、检测高效等突出优势。

该成果可广泛应用于猪基因组染色质构象机制解析、调控元件注释、非编码调控区域变异位点挖掘，为生猪精准育种提供关键技术支撑。

下一步，河南省农业科学院将持续推进探针迭代优化，加快关键育种位点挖掘及应用，以科技赋能生猪产业高质量发展。